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食品微生物(food microorganisms) 是与食品有关的微生物的总称。包括生产型食品微生物(醋酸杆菌，酵母菌等)和是食物变质(霉菌，细菌等)和食源性病原微生物(大肠杆菌，肉毒杆菌等)。食品微生物与人类关系紧密，对食品微生物的了解、利用、和防治在很早以前就有很大的进展了。

与食品有关的微生物。研究食品微生物的性状及其与食品相互关系的科学称为食品微生物学。它是一门由医学、农业、工业的微生物学中与食品生产有关的部分相互融合而成的一门学科。食品微生物包括 3大类。①:通过它的作用,可生产出各种饮料、酒、醋、酱油、味精、馒头和面包等发酵食品。②:是引起食品变质败坏的微生物。③:又称食源性病原微生物。包括能引起人们食物中毒和使人、动植物感染而发生传染病的病原微生物。

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